Documentos de titulación de pregrado de BiotecnologíaContiene los documentos de titulación de pregrado de la Escuela de Biotecnologíahttps://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/75972024-03-20T09:50:55Z2024-03-20T09:50:55ZIdentificación de transcritos quiméricos en modelo de Síndrome de Rett: posibles dianas de intervención terapéuticaAlbornoz Guiñez, Guillermo Ignaciohttps://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/88562023-04-21T21:00:18Z2022-01-01T00:00:00ZIdentificación de transcritos quiméricos en modelo de Síndrome de Rett: posibles dianas de intervención terapéutica
Albornoz Guiñez, Guillermo Ignacio
El síndrome de Rett (RTT) es un trastorno neuronal, que se caracteriza por la pérdida del habla y de los movimientos intencionados de las manos. La causa principal de este síndrome es la mutación del gen de la proteína de unión a metil-CpG 2 (MECP2), cuya función principal está relacionada con la epigenética y la arquitectura de la cromatina, además de tener actividad como represor y activador de genes. Un elemento genético que tiene relación con MECP2 es Long interspersed nuclear elements-1 (LINE-1 o L1), que es un retrotransposón autónomo, y es conocido por su alta expresión y movilidad en el tejido cerebral y su movimiento de "cortar y pegar", que puede generar translocaciones, deleciones y duplicaciones en el genoma. Esto puede conducir a un aumento de la fusión de genes o de transcripciones quiméricas en los casos existentes de este síndrome. En este trabajo se utilizaron bases de datos de libre acceso, principalmente el European Nucleotide Archive, para obtener un total de 100 muestras de RNA-seq de tejido cerebral, de las cuales 50 eran muestras Mus musculus MECP2-KO y otras 50 muestras de silvestres. Éstas se analizaron mediante 2 herramientas computacionales, las cuales fueron STAR-Fusion y ARRIBA, para la detección de transcritos quiméricos, que utilizaron los informes obtenidos de las herramientas para luego filtrar los datos y ver si hay diferencias en el número de transcritos de las muestras MECP2-KO y las muestras silvestres. Los resultados obtenidos a través del análisis muestran que existe un aumento de transcritos quiméricos en las muestras MECP2-KO frente a las muestras silvestres, lo que podría significar que debido al aumento de la expresión de L1 por la deficiencia de MECP2, este retrotransposón provoca un aumento de saltos generando un aumento de transcritos quiméricos en las muestras con síndrome RETT.
Tesis para optar al título de biotecnólogo.
2022-01-01T00:00:00ZNanopartículas de plata modificadas postsíntesis para su uso como agentes antimicrobianosGonzález Torres, Fernando Andréshttps://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/88552023-04-21T20:49:57Z2022-01-01T00:00:00ZNanopartículas de plata modificadas postsíntesis para su uso como agentes antimicrobianos
González Torres, Fernando Andrés
El brote de enfermedades infecciosas emergentes y reemergentes se ha convertido en una carga para la salud pública y las economías de los países. Además, la creciente preocupación por la multirresistencia a los antibióticos actuales ha generado una alarma en la sociedad, lo que ha llevado al desarrollo de estrategias alternativas para el tratamiento de enfermedades infecciosas, transformándose en un área de alto interés. Entre estas estrategias, las nanopartículas metálicas (NPM), que se definen como materiales con morfologías distintivas y tamaños que van de 1 a 100 nm, son una de las soluciones prometedoras, especialmente las nanopartículas de plata (AgNPs), debido a sus propiedades fisicoquímicas únicas. Acorde a esta línea, se plantea la siguiente pregunta: ¿Es posible generar una batería de AgNPs que muestren diferencias en el efecto antimicrobiano dependiente de las morfologías resultantes? Ad hoc, se desarrolló un equipo de irradiación de fácil acceso, y se sintetizó fotoquímicamente disoluciones stock de semillas de AgNPs estandarizadas y reproducibles en el tiempo, estabilizadas por citrato. Luego, la morfología de estos nanomateriales se modificó a través de irradiación de luz a diferentes longitudes de onda, obteniendo una gama de distintas formas, tales como: cubo por irradiación de λ 460 nm; cubo a irradiación de λ 523 nm por 1 h; cuboide, vara, placa triangular y placa pentagonal a irradiación de λ 523 nm por 5 h; cubo y cuboide a irradiación de λ 590 nm; cubo a irradiación de λ 623 nm. Estas se caracterizaron por espectrofotometría UV-visible y microscopía electrónica de transmisión. Después, se apreció actividad antimicrobiana en S. aureus con el tratamiento AgNPs 523 nm 1 h mediante ensayo de supervivencia bacteriana en S. aureus y P. aeruginosa. Luego, por análisis comparativo de diferentes resultados recaudados de fuentes bibliográficas se estimó la actividad antimicrobiana posible en cepas de bacterias S. aureus y P. aeruginosa, y en el hongo C. albicans con respecto a las AgNPs de esta tesis en base a las morfologías obtenidas. Finalmente, se evaluó la citotoxicidad in vitro en queratinocitos humanos inmortalizados (HaCaT), donde se apreció menor grado de citotoxicidad en los tratamientos que en los controles. Como consecuencia, se desarrolló un método controlado para generar AgNPs estructuralmente heterogéneas a partir de un mismo lote inicial, a bajo costo de producción y con alta reproducibilidad, con el telos de evaluar solamente la variable de morfología a partir de la parametrización de variables y observar cómo la morfología afecta el crecimiento antimicrobiano mediante ensayo de supervivencia, seguido de un análisis comparativo bibliográfico del efecto antimicrobiano de las AgNPs. Así, mediante tal scientia, futuras investigaciones podrían plantear y mejorar diversos tipos de tratamientos médicos.
Tesis para optar al título de biotecnólogo.
2022-01-01T00:00:00ZAnálisis in silico de la selección evolutiva de los sitios de glicosilación en proteínas estructurales de Alfa- y BetacoronavirusMorales Olavarría, Mauricio Andréshttps://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/87282022-09-15T00:04:04Z2021-01-01T00:00:00ZAnálisis in silico de la selección evolutiva de los sitios de glicosilación en proteínas estructurales de Alfa- y Betacoronavirus
Morales Olavarría, Mauricio Andrés
Los Alfacoronavirus (Alfa-CoV) y Betacoronavirus (Beta-CoV) son patógenos zoonóticos que circulan en un amplio rango de hospederos. En seres humanos, los Alfa-CoV ocasionan un cuadro de resfriado común, mientras que algunos Beta-CoV han estado involucrados en eventos epidémicos y pandémicos durante las últimas dos décadas. Por lo tanto, nuevos enfoques para enfrentar este tipo de eventos de una manera rápida y eficiente son esenciales. Aproximadamente dos tercios del genoma de estos patógenos codifica dos marcos de lectura, los cuales se procesan para producir proteínas no estructurales; en cambio, la porción restante contiene información codificante para las proteínas estructurales: espiga (S), membrana (M) y envoltura (E). Estas proteínas cumplen funciones que van desde contribuir al soporte estructural hasta definir el tropismo viral. Estas proteínas sufren modificaciones postraduccionales (MPT) tales como glicosilaciones, las cuales se presentan principalmente como N-glicosilaciones, y en menor medida, como O-glicosilaciones. Al igual que muchas proteínas virales, las proteínas estructurales de los CoVs se encuentran bajo la presión selectiva por parte del sistema inmune del huésped, lo cual potencia cambios mayores o menores en los residuos producto de la selección natural. En este estudio se examinaron los residuos de las proteínas estructurales que estén vinculados a sitios de glicosilación (sequons) para identificar ganancia de sequons producto de la selección natural. La estrategia de análisis se centró en evaluar secuencias de proteínas estructurales a través de análisis filogenéticos en busca de selección positiva, combinado con la predicción de sitios de glicosilación, lo cual permite evaluar potenciales sequons bajo selección positiva. El análisis utilizado no identificó sitios de glicosilaciones directamente bajo selección positiva. Sin embargo, se identificó un patrón consenso de glicosilaciones en la proteína S en los CoVs de los géneros Alfa-CoV y Beta-CoV, reportado como O-Follow-N, se identificó la preferencia del sequon del tipo NXT en la proteína S, en contraste con M que posee preferencia por NXS y sitios seleccionados positivamente aledaños a zonas ricas en N- y O-glicosilaciones consenso en la proteína S y M.
Proyecto de tesis para optar al título de Biotecnólogo.
2021-01-01T00:00:00ZParticipación de la proteína STING en la acumulación de grasas y su potencial como biomarcador en la detección temprana de la obesidadGuerra Ramírez, Catalina Javierahttps://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/87272022-09-14T23:54:35Z2022-01-01T00:00:00ZParticipación de la proteína STING en la acumulación de grasas y su potencial como biomarcador en la detección temprana de la obesidad
Guerra Ramírez, Catalina Javiera
La obesidad es un problema sanitario del siglo XXI y que desde el año 1975 se ha triplicado en términos de prevalencia a nivel mundial, alcanzando proporciones pandémicas. La obesidad se caracteriza por una acumulación anormal de grasa en el tejido adiposo y hepático que se traduce como un aumento en el peso corporal, cambiando la dinámica celular y molecular del organismo, lo que puede llegar a perjudicar la salud. La regulación metabólica y el sistema inmunológico preservan la homeostasis de un individuo a través de un vínculo integral de conversaciones dinámicas y coordinadas en los organismos animales. En este contexto, la vía de señalización de STING (Stimulator of Interferon Genes), se ha vinculado a esta regulación metabólica. STING es un mediador clave que desencadena respuestas inflamatorias contra el ADN de doble hebra citosólico potencialmente patogénico o propio, al inducir la secreción de interferones tipo I y citocinas proinflamatorias. Existen escasos reportes que indican que STING estaría participando en el metabolismo, sin embargo, no se han dilucidado los mecanismos a través de los cuales esto estaría sucediendo. Por lo tanto, se planteó como objetivo investigar la participación de la vía de STING en el metabolismo lipídico utilizando ratones C57BL6J (WT) y STINGKO a diferentes edades. Se analizó su peso y consumo de alimento junto con pruebas de comportamiento, así como también, parámetros bioquímicos tales como triglicéridos, colesterol y glucosa. Los resultados evidenciaron un aumento significativo de peso corporal en ratones STINGKO en todas las edades analizadas, no obstante, no estuvo asociado a una mayor ingesta de alimento ni a la falta de actividad física, pero sí estuvo acompañado de una menor fuerza global y aumento de la fatiga en todas las edades medidas. Se comprobó una mayor acumulación de grasa en el hígado y tejido adiposo en ratones STINGKO, acompañados por niveles de colesterol y triglicéridos altos, en comparación con los WT en todas las edades evaluadas. No se observaron diferencias en los niveles de glucosa. En paralelo, fue posible encontrar potenciales relaciones entre STING y enzimas del metabolismo lipídico, y se determinó que la expresión de Tmem173 (STING) se regula a la baja (down-regulated) en condiciones de obesidad y a mayor edad. Así mismo, se determinó qué tipo celular aporta mayores niveles de STING en el tejido adiposo de ratón. Por tanto, estos resultados sugieren que STING participa en la regulación del almacenamiento de las grasas. Y se propone un modelo en el cual STING estaría interactuando con complejos enzimáticos involucrados en la síntesis y transporte de lípidos.
Proyecto de tesis para optar al título de Biotecnólogo.
2022-01-01T00:00:00Z