Transcriptome analysis during ripening of table grape berry cv. Thompson Seedless

View/ Open [Según licencia]
Date
2018-01-10Author
Balic, Iván [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Vizoso, Paula [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Centro de Propagación y Conservación de Plantas - CEPROVEG]
Nilo Poyanco, Ricardo [Chile. FONDAP Centro de Regulación del Genoma]
Sanhueza, Dayan [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Olmedo, Patricio [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Sepúlveda, Pablo [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Arriagada, César [Chile. Universidad de La Frontera. Facultad de Ciencias Agropecuarias y Forestales. Departamento de Ciencias Forestales. Laboratorio Biorremediación]
Defilippi, Bruno G. [Chile. Instituto de Investigaciones Agropecuarias - INIA]
Meneses, Claudio [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Campos Vargas, Reinaldo [Chile. Universidad Andrés Bello, Facultad Ciencias Biológicas, Centro de Biotecnología Vegetal]
Geographic location
Note
Tools
Abstract
Ripening is one of the key processes associated with the development of major organoleptic characteristics of the fruit. This process has been extensively characterized in climacteric fruit, in contrast with non-climacteric fruit such as grape, where the process is less understood. With the aim of studying changes in gene expression during ripening of non-climacteric fruit, an Illumina based RNA-Seq transcriptome analysis was performed on four developmental stages, between veraison and harvest, on table grapes berries cv Thompson Seedless. Functional analysis showed a transcriptional increase in genes related with degradation processes of chlorophyll, lipids, macromolecules recycling and nucleosomes organization; accompanied by a decrease in genes related with chloroplasts integrity and amino acid synthesis pathways. It was possible to identify several processes described during leaf senescence, particularly close to harvest. Before this point, the results suggest a high transcriptional activity associated with the regulation of gene expression, cytoskeletal organization and cell wall metabolism, which can be related to growth of berries and firmness loss characteristic to this stage of development. This high metabolic activity could be associated with an increase in the transcription of genes related with glycolysis and respiration, unexpected for a non-climacteric fruit ripening
URI
http://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/424https://doi.org/10.1371/journal.pone.0190087
Collections
Si usted es autor(a) de este documento y NO desea que su publicación tenga acceso público en este repositorio, por favor complete el formulario aquí.
Related items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Inhibitory effect of biofilm-forming Lactobacillus kunkeei strains against virulent Pseudomonas aeruginosa in vitro and in honeycomb moth (Galleria mellonella) infection model
Berrios, P. [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Escuela de Biotecnología]; Fuentes, J. A. [Chile. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ciencias Biológicas. Laboratorio de Genética y Patogénesis Bacteriana]; Salas, D. [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Centro de Genómica y Bioinformática]; Carreño, A. [Chile. Universidad Andres Bello. Centro de Nanociencias Aplicadas - CANS]; Aldea, P. [Chile. Universidad Mayor. CEAPI Mayor]; Fernández, F. [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Centro de Genómica y Bioinformática]; Trombert, A. N. [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Centro de Genómica y Bioinformática] (Chile. Universidad Mayor, 2017-11-10)Biofilms correspond to complex communities of microorganisms embedded in an extracellular polymeric matrix. Biofilm lifestyle predominates in Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic Gram negative pathogen responsible for ... -
Stg fimbrial operon from S. Typhi STH2370 contributes to association and cell disruption of epithelial and macrophage-Like cells.
Berrocal, Liliana [Chile. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ciencias Biológicas]; Mora, Guido C. [Chile. Universidad Andres Bello. Facultad de Medicina]; Fuentes, Juan A. [Chile. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ciencias Biológicas]; Trombert, Nicole A. [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Centro de Genómica y Bioinformática]; Jofré, Matías R. [Chile. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ciencias Biológicas]; Villagra, Nicolás A. [Chile. Universidad Andres Bello. Facultad de Medicina]; Valenzuela, Luis M. [Chile. Universidad Andrés Bello. Facultad de Ciencias Biológicas] (Facultad de Ciencias, 2015)Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) stg operon, encoding a chaperone/usher fimbria (CU), contributes to an increased adherence to human epithelial cells. However, one report suggests that the presence of the Stg ... -
Effect of incubation temperature after devitrification on quality parameters in human sperm cells
Uribe, Pamela [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Excelencia en Medicina Traslacional]; Rojas, Christian [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Excelencia en Medicina Traslacional]; Merino, Juan [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Excelencia en Medicina Traslacional]; Zambrano, Fabiola [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Excelencia en Medicina Traslacional]; Villegas, JV. [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Biotecnología Reproductiva]; Boguen, Rodrigo [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Biotecnología Reproductiva]; Isachenko, Vladimir [Alemania. Universidad de Colonia. Grupo de Investigación en Medicina Reproductiva, Departamento de Obstetricia y Ginecología]; Isachenko, Evgenia [Alemania. Universidad de Colonia. Grupo de Investigación en Medicina Reproductiva, Departamento de Obstetricia y Ginecología]; Sánchez, Raúl [Chile. Núcleo de Biorecursos Científicos y Tecnológicos CEMT-BIOREN. Centro de Excelencia en Medicina Traslacional]; Treulen, Favian [Chile. Universidad Mayor. Facultad de Ciencias. Escuela de Tecnología Médica] (Chile. Universidad Mayor, 2017-12)Sperm cryopreservation is common in assisted reproduction laboratories, providing a therapeutic option for several clinical conditions. This process has been optimized; however, the effect of post-thaw incubation temperature ...