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dc.contributorMDPI AG.es_CL
dc.contributor.authorRojas-Herrera, Marcelo [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.contributor.authorSanchez, Carolina [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.contributor.authorUndurraga, Soledad F. [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.contributor.authorManque, Patricio [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.contributor.authorMaracaja-Coutinho, Vinicius [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.contributor.authorPolanco, Víctor [Chile. Universidad Mayor. Centro de Genómica y Bioinformática]es_CL
dc.date.accessioned2018-09-07T13:04:15Z
dc.date.available2018-09-07T13:04:15Z
dc.date.issued2015es_CL
dc.identifier.citationVillacreses, J., Rojas-Herrera, M., Sánchez, C., Hewstone, N., Undurraga, S. F., Alzate, J. F., … Polanco, V. (2015). Deep Sequencing Reveals the Complete Genome and Evidence for Transcriptional Activity of the First Virus-Like Sequences Identified in Aristotelia chilensis (Maqui Berry). Viruses, 7(4), 1685–1699. http://doi.org/10.3390/v7041685es_CL
dc.identifier.issnISSN 1999-4915es_CL
dc.identifier.issnESSN 1999-4915es_CL
dc.identifier.urihttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4411674/pdf/viruses-07-01685.pdfes_CL
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.3390/v7041685es_CL
dc.identifier.urihttp://repositorio.umayor.cl/xmlui/handle/sibum/2662
dc.description.abstractHere, we report the genome sequence and evidence for transcriptional activity of a virus-like element in the native Chilean berry tree Aristotelia chilensis. We propose to name the endogenous sequence as Aristotelia chilensis Virus 1 (AcV1). High-throughput sequencing of the genome of this tree uncovered an endogenous viral element, with a size of 7122 bp, corresponding to the complete genome of AcV1. Its sequence contains three open reading frames (ORFs): ORFs 1 and 2 shares 66%–73% amino acid similarity with members of the Caulimoviridae virus family, especially the Petunia vein clearing virus (PVCV), Petuvirus genus. ORF1 encodes a movement protein (MP); ORF2 a Reverse Transcriptase (RT) and a Ribonuclease H (RNase H) domain; and ORF3 showed no amino acid sequence similarity with any other known virus proteins. Analogous to other known endogenous pararetrovirus sequences (EPRVs), AcV1 is integrated in the genome of Maqui Berry and showed low viral transcriptional activity, which was detected by deep sequencing technology (DNA and RNA-seq). Phylogenetic analysis of AcV1 and other pararetroviruses revealed a closer resemblance with Petuvirus. Overall, our data suggests that AcV1 could be a new member of Caulimoviridae family, genus Petuvirus, and the first evidence of this kind of virus in a fruit plant.es_CL
dc.description.sponsorshipEste trabajo fue financiado por: Bioinformatics and Sequencing Cores, del Centro de Genómica y Bioinformática, Facultad de Ciencias, Universidad Mayor.es_CL
dc.format.extentCOMUNICACIÓN BREVEes_CL
dc.language.isoenes_CL
dc.publisherCIENCIASes_CL
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Chilees_CL
dc.subjectCIENCIAS DE LA SALUDes_CL
dc.titleDeep Sequencing Reveals the Complete Genome and Evidence for Transcriptional Activity of the First Virus-Like Sequences Identified in Aristotelia chilensis (Maqui Berry)es_CL
dc.typeArtículo o Paperes_CL
umayor.indizadorCOTes_CL
umayor.politicas.sherpa/romeoLicencia color: VERDE (Revista DOAJ. Se puede archivar el pre-print y el post-print o versión de editor/PDF)--DOAJ es una revista de acceso abierto Pre-print del autor: el autor puede archivar la versión pre-print (ie la versión previa a la revisión por pares) Post-print del autor: el autor puede archivar la versión post-print (ie la versión final posterior a la revisión por pares) Versión de editor/PDF: el autor puede archivar la versión del editor/PDF. Condiciones generales: En repositorios de acceso abierto, La versión de editor/PDF puede utilizarse, La fuente editorial debe reconocerse, Creative Commons Attribution License 4.0, Los autores conservan el copyright, Se anima a los autores a enviar sus artículos publicados a los repositorios institucionales// Disponible en: http://www.sherpa.ac.uk/romeo/issn/1999-4915/es/es_CL
umayor.indexadoWOSes_CL
umayor.indexadoSCOPUSes_CL
dc.identifier.doi10.3390/v7041685es_CL]
umayor.indicadores.wos-(cuartil)Q2es_CL
umayor.indicadores.scopus-(scimago-sjr)sin informaciónes_CL


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